分子流從加熱面直接是到冷凝器的外表。短程分子蒸餾器適合于進行分子蒸餾。分子蒸餾進程能夠如以下的四步：
　　
　?。ㄒ唬?、分子從液相的主體向蒸騰的外表進行分散
　　
　　通常，液適當中分散的速度是操控分子蒸餾的速度首要要素，所以應當是盡量的減薄液層厚度以及強化液層活動。
　　
　?。ǘ?、分子在冷凝面上冷凝
　　
　　只需保證冷熱雙面間有滿足的溫度差（通常為70~100℃），冷凝外表的方式合理且潤滑則以為冷凝過程能夠在剎那間完結，所以挑選合理冷凝器的方式適當主要。而殘氣的分子在雙面之間呈現出的雜亂無章熱運動狀的態，因而殘氣的分子數目多少是影響飛射的方向以及蒸騰速度首要的要素。
　　
　?。ㄈ?、分子從蒸騰的外表向冷凝面進行飛射
　　
　　蒸氣分子從蒸騰面向冷凝面的飛射進程當中，也許互相發作彼此的磕碰，也也許以及殘存于雙面之間空氣分子發作不一樣的磕碰。因為蒸騰的分子遠重于空氣的分子，而且大都是具有一樣運動的方向，所以它們本身的磕碰對飛射的方向以及蒸騰速度影響并不大。
　　
　?。ㄋ模?、分子在液層的外表上進行蒸騰
　　
　　蒸騰的速度是跟著溫度不斷的增加而得到上升，但別離的要素有時卻跟著溫度增加而發作下降，所以應當是以被加工物質熱安穩的性能為其的條件，挑選經濟合理的蒸餾溫度。